वेतन की बात करें तो वाइस चांसलर की सैलरी रजिस्ट्रार से अधिक होती है। भारत के विभिन्न केंद्रीय और राज्य विश्वविद्यालयों में वाइस चांसलर का मासिक वेतन 2 लाख से 2.25 लाख रुपये के बीच होता है, वहीं रजिस्ट्रार का वेतन 1.44 लाख से 1.82 लाख रुपये प्रति माह के आसपास होता है। इसके अलावा वाइस चांसलर को सरकारी आवास, वाहन, सचिवीय स्टाफ और अन्य भत्ते भी दिए जाते हैं, जो इस पद को और अधिक प्रतिष्ठित बनाते हैं। वहीं रजिस्ट्रार को भी सुविधाएं मिलती हैं, लेकिन उनकी तुलना में सीमित होती हैं।